本学科始于五十年代末，1981年分为病理学和病理生理学两个三级学科。病理学科1991年被校级重点学科和一类课程，2006年被评为省级精品课程；病理生理学科2000年被确定为校级重点学科。病理学与病理生理学学科2006年被评为省”十一五”重点学科，2011年被评为省”十二五”强化重点学科。现有教学科研人员30人，其中特聘教授2人，学科教授6人，副教授10人，讲师 10人，助教2人，博士6人，硕士16人。多人分别被评为济宁市有突出贡献的中青年专家、山东省学术骨干学科带头人培养对象、山东省优秀青年知识分子、济宁市科技拔尖人才和新长征突击手等荣誉称号。多名教授分别兼任省、市专业学术委员会或团体副主任委员、常委或委员。
本学科在教学内容、课程体系、教学方法等方面进行了改革和尝试，先后承担和完成了省部级教研课题10余项，其中2项获省优秀教学成果奖，1项获省优秀实验技术成果奖，1项获省社会科学成果奖，1项获省软科学奖，多项课题获市级和学校教学成果奖。发表教研论文30余篇，主编和参编多部教材和著作，为本学科的教学改革和发展奠定了理论基础。
本学科现设有分子病理学、细胞生物学、器官纤维化、DNA检测等7个研究用实验室，主要从事肿瘤分子病理学与细胞生物学、器官纤维化、心血管疾病病理生理、抗肿瘤药物传递的研究，在相应领域形成了自己的研究特色。近几年先后承担和完成6项省部级及20余项厅局级科研课题，多渠道获得科研经费百万余元，科研课题层次和研究水平居省内领先水平。4项科研成果获得省科学技术进步奖，10余项科研成果分别获得省高校优秀科研成果奖和市科技局、学校科技进步奖。在国内外刊物上发表论文近200篇，其中7篇被SCI 和CA收录。与美国、加拿大病理界专家教授建立了学术交流合作关系，与多所部属院校建立了科研及教学协作关系。聘任国内著名病理学教授为客座教授，培养硕士研究生6名。不断扩大对外学习和交流，努力将本学科建设成为教学和科研成果显著、教学体系和教学方法手段先进、竞争创新、产学研相结合的省内一流重点学科。